FortiGate xử lý gói tin theo mô hình “parallel path processing / life of a packet”: khi gói nhập vào, FortiGate thực hiện các bước kiểm tra khởi đầu (L2/L3), lookup session/policy, quyết định đường đi (fastpath hay đi qua CPU/engine), rồi áp dụng các profile bảo mật (IPS, AV, Web-filter, DLP...